এখানে জেনারেল শিক্ষা ও ইসলামী শিক্ষার সমন্বয় করে পাঠদান করা হয়। মাদরাসাতুস সুন্নাহর লক্ষ্য হলো—এমন এক প্রজন্ম গড়ে তোলা, যারা হবে দীনি জ্ঞান ও দুনিয়াবি প্রজ্ঞায় সমৃদ্ধ, নৈতিকতা ও নেতৃত্বগুণে অনন্য।